軍艦旗（FIAV符号：
）是軍艦悬挂以表示所屬海軍的海上旗幟，同时亦表明了船只的军用身份，通常在艦尾或主桅悬挂。在航行及日出至日落的停泊期间均会悬挂军舰旗。部分国家的海军在作战中往往会同时在桅杆上悬挂几面船旗，因为传统上认为降下船旗代表投降[1]。
根据《聯合國海洋法公約》第20條约定潜水船及其他水中航行機器，在沿岸國的領海時必須在海面上航行並懸掛起所屬的旗幟。对潛艇而言，如懸掛起軍艦旗則與其他軍艦無異，在沿岸國的領海時無損其通航權。
政府船只（如海岸警卫队）及商船另有设计商船旗，若干海军另有制定舰艏旗，悬挂在舰艏。
英国海军不列顛尼亞號：舰尾和主桅杆悬挂军舰旗，另在桅杆悬挂海军级别旗，舰艏悬挂舰艏旗。
部分国家并未单独制定单独的军舰旗、商船旗及政府船旗，而仅使用国旗的设计。另一些国家则使用国旗的变体，或单独设计海军旗。其设计可分类如下：
英國皇家海軍的軍艦旗是白船旗。旗面为白地紅十字，左上方为國旗。其设计影响了众多前英国殖民地国家及其他国家的海军旗设计：
部分国家海军旗使用叠加军徽或锚形的旗帜作为海军旗：
部分国家海军旗使用国旗的长比例变体：
北欧及中东欧国家的海军旗多采用国旗的燕尾形式：
苏联自1935年采用白底，下方蓝边的海军旗设计，影响了部分前社会主义国家：
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 苏联 （1950-1992） |
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）是軍艦悬挂以表示所屬海軍的海上旗幟，同时亦表明了船只的军用身份，通常在艦尾或主桅悬挂。在航行及日出至日落的停泊期间均会悬挂军舰旗。部分国家的海军在作战中往往会同时在桅杆上悬挂几面船旗，因为传统上认为降下船旗代表投降[1]。
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