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雲南省政府是中華民國南京國民政府在雲南省的最高地方行政機關。
民國17年,國民政府統一中國後,設置雲南省政府治理雲南。
民國24年(1935年)分昆明縣置昆明市,雲南省省會改置於此。
民國38年(1949年)12月9日,時任雲南省主席盧漢宣布投共。
民國39年(1950年)以後,不支持盧漢投共的人員將雲南省政府由昆明遷至泰國曼谷,直至民國43年(1954年)雲南省政府裁撤。