2006年中国足球乙级联赛是中国足协改革联赛后举行的第三届中国足球乙级联赛，联赛于2006年5月6日展开，预赛10月7日于结束，决赛阶段由10月25日至11月2日于重庆举行，最后由大学生组成的北京理工夺得联赛冠军。
| 排名
|
球队
|
赛
|
胜
|
平
|
负
|
得
|
失
|
差
|
分
|
资格
|
| 1 |
安徽九方 |
16 |
12 |
1 |
3 |
24 |
11 |
+13 |
37 |
进入决赛阶段
|
| 2 |
云南丽江 |
16 |
11 |
4 |
1 |
30 |
14 |
+16 |
34 |
进入决赛阶段
|
| 3 |
武汉雅琪 |
16 |
8 |
4 |
4 |
23 |
16 |
+7 |
28 |
进入决赛阶段
|
| 4 |
宁波华奥 |
16 |
8 |
3 |
5 |
25 |
17 |
+8 |
27 |
进入决赛阶段
|
| 5 |
四川 |
16 |
7 |
5 |
4 |
20 |
19 |
+1 |
26 |
|
| 6 |
广西天基 |
16 |
5 |
3 |
8 |
20 |
27 |
-7 |
18 |
|
| 7 |
上海东亚 |
16 |
3 |
5 |
8 |
26 |
29 |
-3 |
14 |
|
| 8 |
苏州趣普仕 |
16 |
4 |
1 |
11 |
16 |
32 |
-16 |
13 |
|
| 9 |
宁波中豹 |
16 |
0 |
5 |
11 |
4 |
23 |
-19 |
5 |
|
| 排名
|
球队
|
赛
|
胜
|
平
|
负
|
得
|
失
|
差
|
分
|
资格
|
对赛成绩
|
| 1 |
北京理工 |
16 |
10 |
5 |
1 |
32 |
9 |
+23 |
35 |
进入决赛阶段
|
| 2 |
哈尔滨毅腾 |
16 |
9 |
5 |
2 |
23 |
10 |
+13 |
32 |
进入决赛阶段
|
| 3 |
天津火车头 |
16 |
7 |
6 |
3 |
25 |
14 |
+11 |
27 |
进入决赛阶段
|
| 4 |
青岛海鲨 |
16 |
6 |
6 |
4 |
13 |
13 |
0 |
24 |
进入决赛阶段
|
| 5 |
北京巴士 |
16 |
5 |
7 |
4 |
19 |
13 |
+6 |
22 |
|
北京：3分；3-3
新疆：3分：3-3
|
| 6 |
新疆体彩 |
16 |
6 |
4 |
6 |
17 |
16 |
+1 |
22 |
|
| 7 |
天津东丽 |
16 |
3 |
5 |
8 |
9 |
18 |
-9 |
14 |
|
| 8 |
青岛黎明 |
16 |
3 |
2 |
11 |
11 |
35 |
-14 |
11 |
|
| 9 |
辽宁中巴 |
16 |
3 |
0 |
13 |
12 |
33 |
-21 |
9 |
|
注：每区球队对同区球队2次，无需对第二区的球队。南区及北区的前四名球队晋级季后赛（四分之一决赛）。
| 俱乐部
|
首回合
|
次回合
|
点球
|
总比分
|
俱乐部
|
| 北京理工
|
1 - 1
|
2 - 2
|
6 - 5
|
9 - 8
|
天津火车头
|
| 哈尔滨毅腾
|
1 - 1
|
0 - 0
|
3 - 1
|
4 - 2
|
安徽九方
|
| 俱乐部
|
90分钟赛
|
加时赛
|
点球
|
总比分
|
俱乐部
|
| 安徽九方
|
3 - 3
|
0 - 0
|
6 - 5
|
9 - 8
|
天津火车头
|
| 俱乐部
|
90分钟赛
|
加时赛
|
点球
|
总比分
|
俱乐部
|
| 北京理工
|
3 - 0
|
|
|
3 - 0
|
哈尔滨毅腾
|
