細菌DNA結合蛋白

Bac_DNA_binding
Bac_DNA_binding
	anabaena hu-dna cocrystal structure (ahu6)
鑑定
標誌	Bac_DNA_binding
Pfam	PF00216（舊版）
InterPro（英語：InterPro）	IPR000119
PROSITE（英語：PROSITE）	PDOC00044
SCOP（英語：Structural Classification of Proteins）	1hue / SUPFAM
CDD（英語：Conserved Domain Database）	cd00591
Pfam
現有可用的蛋白結構：
Pfam	結構（舊版） / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum（英語：PDBsum）	結構概要

細菌DNA結合蛋白（英語：Bacterial DNA binding protein）又被稱為組蛋白類似蛋白（英語：histone-like proteins）^[1]^[2]，通常為鹼性蛋白質，90個左右氨基酸殘基，與特定DNA位點結合。

例子

Table 1. 三種細菌DNA結合蛋白的比較
DNA結合蛋白	大小	結構	結合位點	效應
H-NS	15.6 kDa	exists in dimers to physically prevent RNA polymerase from binding to promoter	binds to bent DNA, binds to P1 promoter in E. coli	regulation of gene expression
HU	10 kDa	α-helical core and two positively charged β-ribbon arms	binds non-specifically to dsDNA, binds to DsrA, a small non-coding RNA that regulates transcription	induces negative supercoiling into circular DNA
IHF	20 kDa	αβαβ hetrodimer	binds to specific sequences of DNA	creates kinks in DNA

^ Drlica K, Rouviere-Yaniv J. Histonelike proteins of bacteria. Microbiol. Rev. September 1987, 51 (3): 301–19. PMC 373113 . PMID 3118156.
^ Pettijohn DE. Histone-like proteins and bacterial chromosome structure. J. Biol. Chem. September 1988, 263 (26): 12793–6. PMID 3047111.