開放蠕蟲
開放蠕蟲（OpenWorm）是一項旨在從細胞層面在電腦上模擬秀麗隱杆線蟲（Caenorhabditis elegans）的國際性開放科學項目。[1] [2][3]儘管該項目的長遠目標是模擬整個秀麗隱杆線蟲的全部959個細胞，第一階段的計劃是建立包含302個神經元和95個肌肉細胞的模型來模擬蠕蟲運動。這種自底向上的模擬是開放蠕蟲社區追求的目標。目前，此項目的物理引擎Sibernetic已經建好，神經連接組和肌肉細胞也已創建為NeuroML格式。整個蠕蟲的三維解剖模型可以通過瀏覽器自由查看。開放蠕蟲項目也參與了「Geppetto模擬框架」的開發，這是一個為開發有機體的整體建模而創設的多重算法、多尺度的模擬平台。[4]
參考文獻[編輯]
- ^ nematode fanciers open their worm to a kickstarter. [2014-10-17]. （原始內容存檔於2019-12-07）.
- ^ Towards a virtual C. elegans: A framework for simulation and visualization of the neuromuscular system in a 3D physical environment. Palyanov A., Khayrulin S., Larson S.D. and Dibert A. (2012) In Silico Biology 11(3): 137-147. [2014-10-17]. （原始內容存檔於2014-04-22）.
- ^ Current practice in software development for computational neuroscience and how to improve it. Gewaltig, M.-O., & Cannon, R. (2014). PLoS Computational Biology, 10(1), e1003376. doi:10.1371/journal.pcbi.1003376
- ^ Openworm is going to be a digital organism in your browser. [2014-10-17]. （原始內容存檔於2021-11-15）.
外部連結[編輯]
- Homepage: Openworm （頁面存檔備份，存於互聯網檔案館）
- OpenWorm community （頁面存檔備份，存於互聯網檔案館）
- Milestones （頁面存檔備份，存於互聯網檔案館）.
- Sibernetic （頁面存檔備份，存於互聯網檔案館）
- Models （頁面存檔備份，存於互聯網檔案館）
- OpenWorm browser
- Geppetto （頁面存檔備份，存於互聯網檔案館）