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犬冠状病毒HuPn-2018

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犬冠状病毒HuPn-2018
病毒分类 编辑
（未分级）： 病毒 Virus
域： 核糖病毒域 Riboviria
界： 正核糖病毒界 Orthornavirae
门： 小核糖病毒门 Pisuviricota
纲： 小南嵌套病毒纲 Pisoniviricetes
目： 套式病毒目 Nidovirales
科： 冠状病毒科 Coronaviridae
属： 甲型冠状病毒属 Alphacoronavirus
种：
犬冠状病毒HuPn-2018 甲型冠状病毒1型
病毒：
犬冠状病毒HuPn-2018 CCoV-HuPn-2018

犬冠状病毒HuPn-2018（Canine coronavirus HuPn-2018，简称CCoV-HuPn-2018[注 1]）是甲型冠状病毒1型的一个病毒株，由犬冠状病毒（CCoV）与猫冠状病毒（FCoV）经基因重组产生，为动物病毒发生病原溢出而感染人类的案例[1][2]。

发现

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犬冠状病毒HuPn-2018为自2017年－2018年马来西亚沙劳越诗巫医院8名住院的肺炎病患鼻腔检体中发现，于2021年发表[1]。8名病患中有7名为偏乡地区的5岁以下幼童（其中4人为1岁以下）[3]，可能是从家养或野生动物感染此病毒，其中7人同时还有感染其他病毒，经治疗后均在一周内康复[4]。

病毒学

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犬冠状病毒HuPn-2018的基因组长29,083或29,351nt（因其中ORF7b基因序列有长短两种型式而异），基因组结构与其他甲型冠状病毒1型相同[1]。基因定序结果显示此病毒株为犬冠状病毒（CCoV） 与猫冠状病毒（FCoV）融合而成，其基因组大部分与犬冠状病毒TN-449毒株接近（相似度93.3%），与猪传染性胃肠炎病毒（TGEV）Purdue毒株相似度91.5%，与猫冠状病毒WSU 79-1683毒株相似度84.6%[注 2]。但编码刺突蛋白的S基因中，S1序列与犬冠状病毒的另一毒株（UCD-1）较接近（相似度99.2%），S2序列则与猫冠状病毒WSU 79-1683毒株接近（相似度97.1%）。此外此病毒株编码N蛋白的序列有长36nt（12个氨基酸）的删除，不见于其他甲型冠状病毒1型毒株，SARS-CoV的N蛋白也曾发生类似的删除，可能与其传播有关[1]。

后续研究显示此病毒的刺突蛋白可与猫、狗与猪细胞表面的丙氨酸氨肽酶（AP-N）结合[注 3]，以其为受体感染细胞，虽正常情况下不能与人的AP-N结合，但有些人的AP-N可能因一个位点的SNP变异而可被此病毒结合，进而遭到感染[6]。此病毒S蛋白不具S1/S2位的弗林蛋白酶切割位点，因此属于第二型的犬冠状病毒（CCoV genotype II）[1]，但S2'中与其他二型犬冠状病毒、猫冠状病毒及猪传染性胃肠炎病毒一样具有弗林切割位点，可能也与其感染机制有关[6][7]。

相关病毒

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犬冠状病毒HuPn-2018可能为第8种已知可感染人类的冠状病毒（其余7种为造成普通感冒的人类冠状病毒229E、人类冠状病毒NL63、人类冠状病毒OC43与人类冠状病毒HKU1以及造成严重疾病的SARS-CoV、MERS-CoV与SARS-CoV-2）[1]。

除此病毒株外，还有数则研究报导过甲型冠状病毒1型的病毒株从自然宿主（猫、狗与猪）发生病原溢出感染人类的情形[8]。2007年即有研究在2002年－2003年泰国曼谷医院8名呼吸道感染的病人样本中发现犬冠状病毒[9]（但当时被误鉴定为人类冠状病毒229E[8]）；2014年有研究自2010年美国阿肯色州呼吸道感染的3名病人样本中发现与猫冠状病毒近似的病毒株[10]；2021年犬冠状病毒HuPn-2018发表后不久，又有一与此病毒关系接近（刺突蛋白序列仅有2个氨基酸不同，全基因组序列相似度99.4%）的病毒株HuCCoV_Z19Haiti被发表，为自美国佛罗里达州一位甫自海地返国发病的病人中发现[8][11]。这些案例均显示感染动物的甲型冠状病毒可经快速演化与基因重组而发生病原溢出，导致偶发的人类感染，且造成症状大多较为轻微[11]。

参见

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注脚

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  1. ^ 犬冠状病毒-人肺炎-2018（Canine coronavirus–human pneumonia–2018）的简称[1]。
  2. ^ 以上病毒皆属甲型冠状病毒1型。
  3. ^ 犬冠状病毒与人类冠状病毒229E皆是以此蛋白为受体感染细胞[5]。

参考文献

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  1. ^ 1.0 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 Vlasova, Anastasia N.; Diaz, Annika; Damtie, Debasu; Xiu, Leshan; Toh, Teck-Hock; Lee, Jeffrey Soon-Yit; Saif, Linda J.; Gray, Gregory C. Novel Canine Coronavirus Isolated from a Hospitalized Pneumonia Patient, East Malaysia. Clinical Infectious Diseases. 2021, 74 (3): 446–454. PMC 8194511 可免费查阅. PMID 34013321. doi:10.1093/cid/ciab456. 
  2. ^ Pratelli A, Buonavoglia A, Lanave G, Tempesta M, Camero M, Martella V; et al. One world, one health, one virology of the mysterious labyrinth of coronaviruses: the canine coronavirus affair.. Lancet Microbe. 2021, 2 (12): e646–e647 [2023-02-05]. PMC 8577845 可免费查阅. PMID 34778852. doi:10.1016/S2666-5247(21)00282-2. （原始内容存档于2023-02-05）. 
  3. ^ Lianna Matt McLernon. Another new coronavirus has jumped to people. CIDRAP News. 2021-05-20 [2023-02-05]. （原始内容存档于2022-12-08）. 
  4. ^ ALAYNA DEMARTINI. New Human Coronavirus CCoV-HuPn-2018 Identified – Originated in Dogs. SciTechDaily. 2021-05-23 [2023-02-04]. （原始内容存档于2022-08-08）. 
  5. ^ Zehr JD, Pond SLK, Martin DP, Ceres K, Whittaker GR, Millet JK; et al. Recent Zoonotic Spillover and Tropism Shift of a Canine Coronavirus Is Associated with Relaxed Selection and Putative Loss of Function in NTD Subdomain of Spike Protein.. Viruses. 2022, 14 (5) [2023-02-05]. PMC 9145938 可免费查阅. PMID 35632597. doi:10.3390/v14050853. （原始内容存档于2023-02-05）. 
  6. ^ 6.0 6.1 Tortorici MA, Walls AC, Joshi A, Park YJ, Eguia RT, Miranda MC; et al. Structure, receptor recognition, and antigenicity of the human coronavirus CCoV-HuPn-2018 spike glycoprotein.. Cell. 2022, 185 (13): 2279–2291.e17 [2023-02-05]. PMC 9135795 可免费查阅. PMID 35700730. doi:10.1016/j.cell.2022.05.019. （原始内容存档于2023-02-05）. 
  7. ^ Sanchari Sinha Dutta. Scientists characterize a novel zoonotic coronavirus in humans. News Medical. 2022-06-02 [2023-02-04]. （原始内容存档于2022-08-14）. 
  8. ^ 8.0 8.1 8.2 Vlasova AN, Toh TH, Lee JS, Poovorawan Y, Davis P, Azevedo MSP; et al. Animal alphacoronaviruses found in human patients with acute respiratory illness in different countries.. Emerg Microbes Infect. 2022, 11 (1): 699–702 [2023-02-05]. PMC 8890521 可免费查阅. PMID 35156544. doi:10.1080/22221751.2022.2040341. （原始内容存档于2023-02-05）. 
  9. ^ Theamboonlers A, Samransamruajkit R, Thongme C, Amonsin A, Chongsrisawat V, Poovorawan Y. Human coronavirus infection among children with acute lower respiratory tract infection in Thailand.. Intervirology. 2007, 50 (2): 71–7. PMC 7179520 可免费查阅. PMID 17139182. doi:10.1159/000097392. 
  10. ^ Silva CS, Mullis LB, Pereira O, Saif LJ, Vlasova A, Zhang X; et al. Human Respiratory Coronaviruses Detected In Patients with Influenza-Like Illness in Arkansas, USA.. Virol Mycol. 2014, 2014 (Suppl 2) [2023-02-05]. PMC 5004774 可免费查阅. PMID 27588218. doi:10.4172/2161-0517.S2-004. （原始内容存档于2023-02-05）. 
  11. ^ 11.0 11.1 Lednicky JA, Tagliamonte MS, White SK, Blohm GM, Alam MM, Iovine NM; et al. Isolation of a Novel Recombinant Canine Coronavirus From a Visitor to Haiti: Further Evidence of Transmission of Coronaviruses of Zoonotic Origin to Humans.. Clin Infect Dis. 2022, 75 (1): e1184–e1187 [2023-02-05]. PMC 9402678 可免费查阅. PMID 34718467. doi:10.1093/cid/ciab924. （原始内容存档于2023-02-05）. 
  12. ^ Lednicky JA, Tagliamonte MS, White SK, Elbadry MA, Alam MM, Stephenson CJ; et al. Independent infections of porcine deltacoronavirus among Haitian children.. Nature. 2021, 600 (7887): 133–137 [2023-02-05]. PMC 8636265 可免费查阅. PMID 34789872. doi:10.1038/s41586-021-04111-z. （原始内容存档于2023-02-05）. 
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