林肯县(英语:Lincoln County)是美国密苏里州东部的一个县,东隔密西西比河与伊利诺伊州相望。面积1,659平方公里。根据美国2000年人口普查,共有人口38,944人。县治特洛伊。
成立于1818年12月14日。县名纪念美国独立战争将领本杰明·林肯 (Benjamin Lincoln)。