馬拉松郡（英語：Marathon County）是美國威斯康辛州中部的一個郡。面積4,082平方公里。根據美國2010年人口普查，共有人口134,063人。郡治沃索（Wausau）。
馬拉松郡成立於1807年。郡名來自希臘的馬拉松。
目前美國所出產的花旗參有多達95%來自馬拉松郡。
